Současný výchovně vzdělávací subjekt – OA, SOŠ a SOU Třeboň vznikl spojením čtyř škol – v roce 2004 SOU zemědělského Třeboň a Integrované střední školy sklářské Chlum u Třeboně, v roce 2006 SOŠ, SOU a OU Třeboň se SPŠ oděvní Třeboň a v roce 2012 SOŠ a SOU, Třeboň s Obchodní akademií Třeboň .
Výuka poctivého řemesla
Původní Živnostenská pokračovací škola v Třeboni zahájila výuku v nové budově (nynější ulice Vrchlického 567) v roce 1938.V průběhu let škola vyučovala řadu učebních oborů. V roce 1950 přešla pod Ústředí pro mechanizaci zemědělství (ÚMEZ) a začala se specializovat na technické obory jako např. zámečník, strojní zámečník, traktorista-opravář. Později se výuka soustředila na obory opravář zemědělských strojů a automechanik a název školy se změnil na SOU zemědělské Třeboň.
V roce 2004 byla ukončena činnost sklárny v Chlumu u Třeboně. Její uzavření mělo fatální následky pro výuku sklářských oborů v jižních Čechách. ISŠ sklářská musela opustit sedmipatrovou budovu, kterou využívala již od jejího postavení v 60. letech minulého století.
V roce 2006 došlo v rámci optimalizace škol k připojení Střední průmyslové školy oděvní, protože klesal počet studentů na této škole. Otevřením nových oborů se podařilo tuto budovu naplnit studenty a dnes je součástí školy.
V roce 2012 došlo k obdobnému problému u Obchodní akademie, Třeboň, takže došlo k také připojení této školy.
Sloučení škol
Sloučením naštěstí nedošlo k narušení nebo zhoršení profesní přípravy jednotlivých oborů, neboť ty pouze rozšířily nabídku původního zemědělského učiliště – dnes škola používá název OA, SOŠ a SOU, Třeboň.
V současnosti škola poskytuje středoškolské vzdělání v oborech opravářských, uměleckých sklářských, oděvnických, ekonomických a oborech služeb.
Anglický jazyk 
Anglický jazyk 
Německý jazyk 
Španělský jazyk 
